随着工农业的发展，千千的化学物质被排放到水中，但是仅通过监测特定的理化指标难以全面评价水污染情况。而水质生物毒性检测与常规理化监测相比，可以全面、直观、快速地评价水体污染状况，弥补理化指标监测的不足。之前环境部发布的《应对新型冠状病毒感染肺炎疫情应急监测方案》也新增了水质生物毒性检测和余氯检测，主要用于保障供水安全，预警突发环境污染事件、医疗废水非法排放、消毒产品大量使用引发的次生环境灾害。水质生物毒性检测不仅是疫情防控过程中的监测指标，也将在未来水环境预警系统的建设中作为一种预警手段发挥不可磨灭的作用。
水质生物毒性检测方法参照的标准是《水质 急性毒性的测定 发光细菌法》，这个方法是一种以明亮发光杆菌作为受试生物，以氯化汞作为参比毒物的水样急性毒性快速检测方法。基于明亮发光杆菌相对发光度与水样毒性组分总浓度呈显著负相关性，通过生物发光光度计测定水样的相对发光度，计算其急性毒性水平。水质急性毒性水平选用相当的参比毒物氯化汞浓度来表征，或选用ec50值（半数有效浓度-以样品液百分浓度为单位）来表征。
让受试生物暴露在被测水样中，根据观察到的受试生物的反应（例如死亡、行为异常、生理特征变化等）作出的水样对受试生物的负面影响的评价。根据受试生物不同，水质生物毒性检测常见标准如下：
在水质生物毒性检测中，《水质 急性毒性的测定 发光细菌法》gb/t 15441-1995与《费氏尔弧菌 水质样品光抑制的测定》iso-11348-3都可以用于重金属、有机污染物、农药等有毒有害物质的预警监测。这两种水质生物毒性检测标准所基于的基本原理一致：都是通过检测水样中毒性物质对发光细菌发光效应的抑制作用来反映水样毒性水平；且都采用海洋中提取的发光细菌作为受试微生物，检测方法及检测结果趋势具有一致性。两种方法目前都是生态环境部门常用的生物毒性检测手段，都可在实验室条件下作为急性毒性测定方法也可以作为在线手段实时监控预警。
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