为了控制自然环境中的总磷含量，我国在《水污染防治行动计划》中将总磷纳入基本总量排放控制和重点监测污染物，总磷在线分析仪作为主要监测总磷的仪器，其准确性和可靠性关系到总磷监测数据的真实性，数据质量对监测结果至关重要。但是总磷在线分析仪使用中时常会遇到一些问题，如果总磷在线监测仪检测不准确时该怎么办呢？
总磷在线分析仪在使用中存在的问题主要是波长选择不当和显色不充分问题。我国标准方法都使用700nm 比色测定，但是在总磷在线监测中使用的杂多酸在690 ～ 730nm 有明显的宽系数峰，最大峰值在710nm。而且我国湖泊各不相同，所以需要不同的波长，不能用同样的波长，使结果出现误差，所以在进行总磷在线监测的时候要先对样品进行处理和统计，选择合适的波长。
而且总磷在线分析仪使用磷钼杂多酸法显色时会受到溶液的配置和温度的影响。不同的试液温度会导致完全不同的显色速度，从而产生完全不同的总磷监测数据。溶液的配置方法不对，也会造成显色不稳定，从而造成监测结果出现错误。
为解决总磷在线分析仪检测中波长选择不当问题，可根据水样的不同，选择不同波长。在测定低含量磷时可使用710nm，而测定高浓度磷时，为了减少水样稀释的操作或避免引入稀释误差，可选用680 ～ 750nm波长测定。为解决总磷在线分析仪显色不充分问题，应控制试液的温度和保证钼酸铵溶液的合理配置。如果显色水样温度低于15摄氏度，显色很慢且不完全，一般在20摄氏度以上较好，最好将标准系列和水样在20 ～ 30摄氏度水浴中显色15min。而且在配制钼酸铵溶液时不应将其缓缓倒入硫酸溶液中，如果这样做，反而会使显色不充分。
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